We have developed and implemented [1,2] infrastructure and RDF storage for the Semantic Web. When we filled it with data the need for some tool that could explore the data became evident. Unfortunately, none of existing solutions fulfills requirements imposed by the data and users expectations. This paper presents our RDF visualizer that was designed specifically to handle large RDF data by means of incremental navigation. A detailed description of the algorithm is given as well as actual results produced by the visualizer.

V tomto příspěvku je popsán přístup k virtuální integraci dat využívající současných principů, metod a nástrojů sémantického webu. Přístup pracuje s daty ve formátu RDF a předpokládá dostupnost ontologií, které je popisují. Ontologie jsou základem pro všechny kroky prezentovaného integračního procesu. Jsou využity jak k určení vztahů mezi daty a poskytovaným integrovaným pohledem, tak i k zápisu nalezených korespondencí. Ty jsou dále použity při zpracování dotazů kladených na integrovaná data.

Článek se zabývá přístupem, jak se pokusit zautomatizovat mnohdy netriviální úlohu nalezení pravidel pro integraci dat. Předkládaný přístup automaticky generuje kandidáty pravidel včetně jejich ohodnocení pomocí nepřímé míry definující jejich prioritu. Priorita může následně být použita buďto návrhářem (člověkem) jako pomocný prvek pro přípravu návrhu, nebo při automatickém návrhu integračního procesu zahrnující pravidla s maximální prioritou. Studie v příspěvku se detailně věnuje dvěma základním typům pravidel, ekvivalenci a hierarchii, přičemž ohodnocení kandidátů je založeno na (strukturální) analýze aktivních domén atributů. V neposlední řadě příspěvek ukazuje možnost decentralizovaného přístupu k integraci dat, jenž je inspirován webovými technologiemi.

As the popularity of XML as a format for data representation grows the need for storing XML data in an effective way grows as well. Recent research has provide us with effeective solutions based on storing XML data into relational databases and with new technologies based on storing XML data in the native form. However, design of XML databases has not been studied su±ciently yet. In this paper, we suppose a set of XML schemes that describe XML representation of our data in several types of XML documents. We show that we can not usually store the data directly in this representation because it can contain redundancies. To design an optimal database schema we therefore need to locate these redundancies and eliminate them.We describe two types of redundancies in XML data in this paper and show how to utilize a conceptual schema of the XML schemes to locate such redundancies. We also show how to normalize the XML schemes to eliminate these redundancies.

The notion of preference poses a new prospect of personalization of database queries. In addition, it can be exploited to optimize query execution. Indeed, a novel optimization technique involving preference is developed, and its algorithm presented.

Zatímco dílčí ontologie pokrývají jeden pohled na úzce vymezenou oblast, mnohé aplikace vyžadují obecnější přístup k popisovaným datům. Z tohoto důvodu se přistupuje ke srovnávání ontologií (Ontology Matching), které, pokud je to možné, transformuje několik různých ontologických popisů do jediného. Příspěvek popisuje případovou studii takového procesu za využití různých metod, srovnává jejich úspěšnost a diskutuje možnost využití dílčích výsledků k definici výsledné ontologie. Pro experiment byly nezávisle vytvořeny dvě triviální ontologie, které byly různými nástroji a metodami integrovány do jedné.

Vize sémantického webu byla představena před skoro již 10 lety, avšak žádná z její aplikací prozatím nedokázala oslovit takové množství lidí, jaké dnes používá web v současné podobě. Příspěvek se věnuje možnostem sémantického webu a přínosům, které může přinést pro koncové uživatele. Nejprve podává přehled o současných technologiích i jejich použití a následně diskutuje možnosti plynoucí z použití odkazů v prostředí sémantického webu tak, jak je známe z webu současného, tedy rozšiřující, zpřesňující či udávající kontext prezentované informace.

The thesis deals with security hazards in distributed environments where traditional centralized approaches are only of limited serviceability. One of the very successful model for treating security and access management in distributed systems are so called reputation systems. The main goal of the rep- utation systems is to provide entities in the environment with mechanisms for inferring and building trust consequently used for access control. If the trust between two entities is high enough, transactions are likely to be allowed. The thesis proposes a new security model with trust management system for dynamic and distributed environments with huge number of entities. In dynamic systems new entities or relationships are likely to emerge or existing entities or relationships may often disappear. Such dynamics pose severe problems even for traditional reputation systems. Therefore our approach differs from the traditional ones in the way adopted for establishment and management of trust between entities in our point of view trust is not assigned to particular relationships but the trust is common for a group of entities. In this way, our proposal significantly enhances ability to infer trust between entities with no previous personal experiences with each other or in environments with huge number of entities. For the proposal differs in understanding of trust, it uses a hypergraph model for representation of system of entities. The security model proposed in the thesis contains two algorithms for transformation of a general input graph structure into hypergraph model, an algorithm treating dynamics of the distributed environment and a security subsystem. Our experimental implementation SecGrid utilizes proposed algorithms and it is used for experimental verification of the security models. The experiments investigate ability of the transformation algorithms; in details the dynamic part of our proposal together with the security subsystem proposed specially for the hypergraph model. Experiments show that our model overcame the traditional graph model in many ways especially in dynamic environments with huge amount of entities.

Despite the tremendous research activity in the field of searching engines for the Internet, current searching engines still face some severe limitations. The paper presents an idea of a distributed data source environment to be build on the current state of the art technologies available on the Internet. The paper combines recent advances in the fields of a data inconsistency, a data integration and reputations of sources for further refinements of data searching and sharing processes. The paper generalizes the data binary formalism narrowly connected with the ideas of the semantic web into the <0,1> interval to enable the consideration of uncertainty at various levels.

While partial ontologies cover view at one-track area, many applications require much more general approach to describe their data. On this account it approaches to ontology matching as a headstone of further operations, that can transform several ontological descriptions into one. This paper describe case study of such process with using different methods, confront their fruitfulness and discuss a possibility of using particular results to definition of final ontology. Two trivial ontologies were created (independently of any tool) and they were matched using various selected tools.

A computational model of molecularly communicating mobile nanomachines is de¯ned. Nanomachines are modelled by timed probabilistic automata augmented by a severely restricted communication mechanism. We show that for molecular communication among such machines an asynchronous stochastic protocol originally designed for wireless communication in so-called amorphous computers with static computational units can also be used. We design an algorithm that using randomness and timing delays selects with a high probability a leader from among sets of anonymous candidates. This enables a simulation of counter automata proving that networks of mobile nanomachines possess universal computing power.